Comme cela a été évoqué auparavant, WinRoute est totalement capable de faire passer le trafic des protocoles VPN les plus répandus: Le Protocole de Sécurité IP (IPSec) proposé par l'IETF, et le PPTP (Point-to-Point Tunneling protocol), rendu populaire ces dernières années par la percée des systèmes d'exploitation Microsoft Windows.